Des années après le grand cataclysme et la disparition d'Eikos, alors que la planète s'est fracturée en une multitude de terres flottant sans but, les peuples ont perdu espoir et attendent la disparition de leur monde. Mais l'esprit de l'Entité gardienne de l'équilibre est toujours présent et cherche un nouveau réceptacle de chair pour redonner la vie à son monde.